Если Вы собираете вместе файлы форматов .PDF и .DJVU, физически хранящиеся на сервере Либгена (это нехудожественные книги по бизнесу, компьютерам, истории и т.п.), а Либген в этот момент вдруг лежит и плохо доступен, такое вполне реально.
Как Вы и решили: качайте такие файлы по одному.

FB2-файлы собираются в один архив и скачиваются без багов, сейчас проверил.

UPD. В какие дни, часы и по каким причинам Либген недоступен - тайна сия велика есть.

Что-то я не поняла. По Инету посмотрела значение слова "выкачать", получилось, как будто я эти книги(которые захочу выкачать) просто удалю. А в обрывках комментариев смутно ползёт мысль, что это наоборот, скачивание сразу нескольких книг. И чему верить???