Борис Львович Пугачев родился в Москве в 1953 году в семье учителя иностранных языков и инженера. После окончания школы в 1970 году поступил в Московский инженерно-физический институт на факультет экспериментальной и теоретической физики.

В 1975 году распределён во ВНИИ Стали, где работал до 1990 года сначала инженером, затем младшим и старшим научным сотрудником, начальником сектора, начальником лаборатории. С 1977 года ежегодно в составе подразделений особого риска участвовал в испытаниях ядерного оружия на Семипалатинском полигоне.

В 1986-87 годах его научные разработки были успешно использованы при ликвидации аварии на Чернобыльской АЭС.

В 1990 году, окончив в Болгарии школу управления научно-техническим прогрессом, перешёл на должность генерального директора НПО "Омега", где наряду с основной деятельностью в рамках программы развития производства товаров народного потребления возродил уникальные русские традиции камнерезного и ювелирного дела, результатом чего явилось создание ряда высокохудожественных изделий, отмеченных многочисленными дипломами международных выставок. С 1994 года руководит Советско-Танзанийским предприятием "Алтан" и одновременно выполняет обязанности директора по науке совместного Советско-Американского предприятия "Приоритет", осуществляя международные программы в области биотехнологий, строительства и разведки полезных ископаемых, разрабатывает новые модели экономики переходного периода.

С 1994 по 2004 годы учреждает производственные и коммерческие фирмы, в которых первым в стране совместно с известными европейскими дизайнерскими концернами осуществляет светотехнические разработки, заложившие основы современных технологий эксклюзивного комфорта помещений и с их использованием создаёт уникальные системы, получившие международное признание, как эталонные элементы обитаемой среды.

В 2004 году, после окончания школы спецподготовки "Витязь", избирается президентом РОО "Центр содействия защите предпринимательства", занимающейся комплексным консалтингом и инвестированием в области малого бизнеса.
Борис Пугачев имеет научные степени доктора технических наук (1988 г. ), доктора физико-математических наук (2000 г. ), звание профессора (2001 г. ). Является действительным членом отечественных и международных Академий. Ему принадлежит авторство 135 научных трудов, 45 изобретений, он удостоен отраслевых и правительственных наград.